履约保函和保证金的区别在于履约保函在办理的时候手续非常的繁琐，但是在保函当中会有一个明确的有效期，在到了这天之后，乙方的钱就会自动从银行获得自由，而不需要甲方同意或者是不同意。
银行保函手续费不是统一的，对于不同的银行，不同的保函形式保函的收费是不同的。比如工商银行开具非融资类人民币保函应根据保函风险度按季收取保函金额0.5‰-3‰的手续费。履约保函和预付款保函手续费300元，投标函手续费100元，其他类保函手续费100元。对优质客户，经分行审批，可减收手续费。所以说不能确认具体数额。
支付保函：是应业主(买方)申请，向施工方(卖方)提供保证担保，在施工方(卖方)按合同正常提供货物、相关服务或完成约定工程量后，如业主(买方)不按约定支付合同款项，则担保方接到施工方(卖方)索赔通知后代为支付相应款项
保函有什么作用呢？
在采购、工程等项目上体现的比较多。一般的工程项目，甲方为了保障自己的权益，都会要去中标的公司，在签订合同以后，先交一部分保证金到甲方账户，以后一旦发生纠纷，自己的损失会少一点。但是对于一个公司来说，流动资金会关系到公司项目的进度，一般不愿意把大额的钱给到甲方，这个时候就可以通过保函的形式，用保函替代现金交给甲方。保函的出现对于双方其实是一个双赢的事情，甲方利益有保障，乙方也有足够的流动资金运作公司，所以现在很多需要保证金的项目都愿意开具保函，这不限制于工程项目，也包括了采购、招标等等。