履约保函和保证金的区别在于履约保函在办理的时候手续非常的繁琐，但是在保函当中会有一个明确的有效期，在到了这天之后，乙方的钱就会自动从银行获得自由，而不需要甲方同意或者是不同意。
反担保方式为保证担保，不需要做抵押质押。非敞口部分的保证金由我司，有我司打入在银行进行冻结，退保时无息退回;如果保函量大，可去我司合作银行开保证金冻结账户，由贵方直接打钱到你方冻结账户进行冻结，利息按银行存款利息计算。
保函费指工程合同造价的10%(各银行要求可能不同)的甲方银行支付保函费，乙方10%的履约保函以及5%的民工工资保函所产生的费用，如果直接去行办理银行保函，银行会收取手续费，或找担保公司代理，也会产生一定的费用，也可以叫保函手续费。
工程履约保函种类：
（一）投标保函：即招投标过程中要求投标人提供银行出具的保函，以担保投标材料真实、中标后不会因不正当理由不订立合同。担保金额一般为招标价的3%。
（二）预付款保函：即担保预付款会按照合同要求使用。通常施工企业提供一张预付款保函给业主（开发商、保函受益人），业主即拨付同等金额的预付款给施工企业。担保金额一般为合同价的10%-30%。
（三）履约保函：即担保企业签订施工合同后，能按合同履约。担保金额一般为中标价或者合同价的10%-30%。
（四）农民工工资支付保函：即担保业主或者施工企业不拖欠农民工工资。通常受益人是工程所在地社保局或者劳动局或者建设局。
（五）质量保函：即工程竣工验收之后，担保工程质量不出问题。通常质量保函的期限是两年，担保金额为合同价的3%-10%。