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医院是首批国家临床教学培训示范中心，临床技能实验教学示范中心，设有17个学科系、2个教研室。承担着博士后、博士、硕士、本科生、留学生多个层次的教学培养任务和国家继续医学教育项目、陕西省全科医师培训工作，培养的上万名高级医学人才遍及全国各地及世界。承担国家卫生部高等医药院校统编教材编修任务，获得数十项国家、省部级教学成果奖和现代教育技术成果奖。现为“临床技能实验教学示范中心”、全国“住院医师规范化培训基地”“专科医师规范化培训制度试点基地”，陕西省“研究生示范性联合培养基地”。
医院与省内外百余家基层医院建立托管、医联体和协作关系，充分发挥国家队的指导作用。被确定为国家区域医疗中心项目建设输出西安交通大学第二附属医院洛阳医院、西安交通大学第二附属医院新疆医院、西安交通大学第二附属医院杨凌示范区医院。医院坚持履行国家公立医院的社会责任，数十年如一日下乡巡回医疗、医疗扶贫、援助基层，对口支援西藏阿里地区、新疆等地区，进行医疗帮扶，多年承担苏丹、马拉维等非洲国家的医疗援助工作。在重大自然灾害、紧急抢险及疫情防控等公共卫生事件中充分发挥医疗应急救援职责、派出医护专家指导、救治在线，受到各级政府的高度肯定。